在股票市場中，滬港通和深港通的定義不同、互聯(lián)互通的雙方不同、標的不同等等。

滬港通是指上海證券交易所和香港聯(lián)合交易所允許兩地投資者通過當?shù)刈C券公司（或經紀商）買賣規(guī)定范圍內的對方交易所上市的股票，是滬港股票市場交易互聯(lián)互通機制。而深港通指的是深圳證券交易所和香港聯(lián)合交易所有限公司建立技術連接，使內地和香港投資者可以通過當?shù)刈C券公司或經紀商買賣規(guī)定范圍內的對方交易所上市的股票，屬于深港股票市場交易互聯(lián)互通機制。

雖然，滬港通和深港通的港股通是市值50億港幣以上的恒生綜合小型股指數(shù)成份股，但最大的區(qū)別在于深市有中小板和創(chuàng)業(yè)板，深市的成長股是滬港通和港股市場的補充。深港通與滬港通對比，深港通的標的就不局限于AH股同時上市，而還包含深市成份股，由于深市成份股與滬市有很大區(qū)別，這會使香港市場的投資范圍擴大。